BrAPI, "Breeding API" olarak da bilinen "Plant Breeding Application Programming Interface", bitki ıslahı ve genetik kaynaklar alanında çalışan araştırmacıların ve uygulayıcıların verileri paylaşmak ve etkileşimde bulunmak için kullanabileceği bir API (Application Programming Interface) standardıdır.
Devamı...
Illumina ve Affymetrix, moleküler biyoloji ve genetik araştırmalarda kullanılan mikroarray teknolojisinde önde gelen şirketlerdir. Mikroarray, aynı anda binlerce genin ifadesini ölçebilen bir teknolojidir ve gen ifadesi analizi, genotip tespiti, dizi analizi ve genom genotipleme gibi birçok alanda kullanılır.
Devamı...
Genotipleme, bir bireyin DNA'sındaki belirli genetik varyasyonları belirleme işlemidir. Bu varyasyonlar, tek bir nükleotid değişiklikleri (SNP'ler) veya daha büyük DNA parçaları (insertions, deletions, copy number variations) şeklinde olabilirler.
Devamı...
Veri, ham gözlem ve ölçümlerdir. Dolayısıyla ham veriler temiz gelmezler ve onları işlemek gerekir. Örneğin bazı verileri, cihazlar bazen doğru ölçmeyebilir ya da doğru ölçülmüş veriyi, uzmanlar hatalı bir değer olarak kaydedebilirler.
Devamı...
Tüm genomu bilmenin ne gibi faydaları olabilir?
Devamı...
Genomdaki genlerin ve tüm kodlama bölgelerinin yerini belirleme ve bu genlerin ne yaptığını belirleme işlemine Gen Annotasyonu denir.
Devamı...
De novo assembly(De novo bireştirme), herhangi bir referans genom kullanmaksızın kontiglerin birleştirilmesi işlemidir. Genom dizisi bilinen (re-sequencing) ve bilinmeyen (de novo) olarak isimlendirilir.
Devamı...
TASSEL, ilişkilendirme haritalaması (Association mapping), evrimsel kalıpları ve bağlantı dengesizliğini değerlendirmek için bir yazılım paketidir.
Genomda hareket edebilen transpozonlar, zıplayan gen ya da junk DNA olarak biliniyorlar. Türkçe'de zıplayan/sıçrayan gen olarak da geçiyor.
cDNA, tamamlayıcı DNA veya komplementer DNA. Ters transkriptaz enzimiyle katelizlenen bir reaksiyonda şablon olarak kullanılan olgun bir mRNA'dan sentezlenen DNA parçasına verilen addır. cDNA, mRNA molekülünün çift zincirli DNA parçasıdır.
Devamı...
Biyoinformatik dünyasına kaliteli, özgün ve Türkçe içerikler kazandırmayı hedefleyen bir platform..
