Biyoinformatik dünyasına kaliteli, özgün ve Türkçe içerikler kazandırmayı hedefleyen bir platform..

friends friends friends

F Kendileşme Katsayısı

Bir popülasyonda kendileşme var mı yok mu? ya da alt popülasyonlaşma, alt gruplar var mı yok mu? öğrenebilmek için F kendileşme katsayısını hesaplayıp bu değere göre bir yorum yapabiliriz.

F değerini, beklenen ve gözlenen genotip frekansları arasındaki heterozigotluğa bakarak bulabiliriz.

F Değeri Hesaplama

F Kendileşme Katsayısı

Örnek

Aşağıda bir popülasyona ait Gözlenen Genotip değerleri verilmiştir. Buna göre hesaplayacağınız F değerine bakarak yorumlayınız.

F Kendileşme Gözlenen genotip sayıları

1- Gözlenen Genotip Frekansları

Gözlenen genotip frekanslarını hesaplıyoruz ancak F değerini hesapmamak için bize Gözlenen Heterozigotluk lazım.

F Kendileşme Gözlenen heterozigotluk

2- Allel Frekansları

Beklenen Genotip Frekansını hesaplamak için öncelikle Allel Frekanslarını hesaplamamız gerekir. İki tane Allel var, Allel frekansları P ve q aşağıdaki gibi hesaplanır:

F Kendileşme Allel Frekansları

3- Genotip Frekansları

Bunu daha önce hesapladığımız allel frekanslarını kullanarak hesaplayacağız. HW'ye göre dengede olan bir popülasyon için beklenen genotip frekanslarının oranları P2 : 2Pq : q2'dir ve aşağıdaki gibi hesaplanır:

F Kendileşme Beklenen Heterozigotluk

4- F Değerini Hesaplama

F kendileşme katsayısını hesaplamakiçin daha önce bulduğumuz HB(Beklenen Heterozigotluk) ve HG (Gözlenen Heterozigotluk) değerlerini kullanacağız:

F Kendileşme F değerini hesapla

F Değerine Bakıp Yorumlama

F=1 Popülasyon tamamen homozigottur.

F=0  Beklenen Heterozigotluk ve Gözlenen Heterozigotluk birbirine eşittir. HW dengededir.

F>0 Homozigot fazla, inbreeding, kendileşme vardır.

F<0 Heterozigot fazla

Hesaplanan F(kendileşme katsayısı) değeri: 0,657'dir. F değerine bakarsak, F>0 olduğunu görürüz. Dolayısıyla kendileşme yani Homozigotluk(AA veya aa) artmış, heterozigotluk(Aa) azalmıştır. Kendileşme(inbreeding) ve pozitif tercihli eşleşme vardır diyebiliriz.

Ayrıca F değeri 1'e yaklaştığı için: alt popülasyonlaşma ya da alt gruplar vardır yorumu yapabiliriz.

F kendileşme katsayısı F değeri hesaplama F değeri yorumlama
0 Beğeni
Önceki Yazı

GenAlEx

27 Eyl. 2022 tarihinde yayınlandı.
Sonraki Yazı

Regresyon & Korelasyon

27 Eyl. 2022 tarihinde yayınlandı.
arrow