Dizin Değiştirmek
home
dizinine geçmek
cd /home
Üst Dizine Geçmek
cd ..
Ana Dizine Geçmek
Nerede olursanız olun Ana dizine geçmek
cd ~
Hangi Dizinde Olduğunuzu Öğrenmek
pwd
Dizindeki Dosya ve Klasörleri Listeleme
ls
Dizindeki Dosya ve Klasörleri Ayrıntılı Listeleme
ls -altr
Dizindeki Dosya ve Klasörleri Uzunca Listeleme
ls -l
Hangi Kullanıcı Olarak Oturum Açtınız
whoami
Başka Hangi Kullanıcılar Var?
who
Yeni Dosya Oluşturmak
SNP_veriler.txt
adında yeni bir dosya oluşturmak için:
touch SNP_veriler.txt
Dosya İsmi Değiştirmek
mv file-name.txt/ new-file-name.txt
Dosya Silmek
SNP_veriler.txt
adındaki dosyayı silmek için:
rm SNP_veriler.txt
İçi Dolu Klasörü Silme
f: force (silme işlemi için emin misiniz diye sormaz)
r: recursive (içindeki klasor, dosya) hepsini siler
rm -fr file-name
Yeni Dizin Oluşturmak
sekanslar
adında yeni bir dizin(klasör) oluşturmak için:
mkdir sekanslar
Dizin Silmek
sekanslar
adında dizini silmek için:
rmdir sekanslar
Dosya Düzenlemek
nano veri.txt
İlgili Diğer Komutlar
man ls
#veya
ls --help
URL'den Dosya İndirmek
Uzak sunucudan dosya çekmek için:
wget "https://github.com/mahmutt/test/blob/master/alis.html"
Dosya Kopyalamak
cp dosya-1 dosya-2
Dosyayı Açmadan İlk 10 Satırı Görmek
head veri.txt
Dosyayı Açmadan İlk 50 Satırı Görmek
head -50 veri.txt
Dosyayı Açmadan Son 10 Satırı Görmek
tail veri.txt
Dosyayı Açmadan Son 50 Satırı Görmek
tail -50 veri.txt
Dosyanın İçerdiği Satır Sayısı
wc veri.txt
Dosyayı Tamamen Görmek İçin
cat veri.txt
Dosyanın Belirli Bir Kısmını Açıp İlerledikçe Gösterir
less veri.txt
Metin Dosyasını UNIX Formatına Çevirmek
dos2Unix /home/veri.txt
Dosyadan Tüm '\r' Karakterlerini Silme
tr -d '\r' veri.csv
Tüm küçük harfleri BÜYÜK HARFE çevirme
tr '[a-z]' '[A-Z]' < veri.csv
Unix/Linux Command Reference
Kaynaklar
- https://twitter.com/heyValdemar
- Genomik Analiz İçin BİYOİNFORMATİK Yöntemler | Muhammet ŞAKİROĞLU