Mikrosatellit=SSR markörler, bitki DNA'sında bulunan 2-4 baz uzunluğundaki (GA)n, (CA)n,(AT)n, (ATA)n, (CTT)n ve (GATA)n gibi çekirdek motiflerini içeren 100' bp den küçük tekrar ünitelerindeki farklılıkları içerir.
SSR'lar genetik anlamda nötral ve eş-baskındır(codominant). Genellikle bunlar akrabalık ve topluluk araştırmaları için marker(belirteç) olarak kullanılır.
Popülasyon genetik çeşitliliği hakkında bilgi edinilecek en iyi markörlerden biri mikrosatellittir.
Gen bağlantı haritaları, Popülasyon çalışmalarında, ebeveyn tayini, Genetik çeşitlilik, Akrabalık ve topluluk araştırmalarında, Genetik uzaklığın belirlenmesi, Ebeveyn-döl tanısı alanlarında kullanılmaktadır.
