The Cancer Genome Atlas (TCGA), kanser genomi araştırmalarını büyük ölçekte sistematik biçimde incelemek için kurulmuş bir biyomedikal araştırma girişimidir. 2006’da National Cancer Institute (NCI) ve National Human Genome Research Institute (NHGRI) tarafından başlatılmıştır. Proje, birçok kanser türünde moleküler değişiklikleri tanımlayarak kanser biyolojisinin anlaşılmasına öncülük etmiştir.
TCGA, farklı kanser türlerinde DNA mutasyonları, RNA ekspresyonu, DNA metilasyonu ve protein düzeyleri gibi çok katmanlı moleküler verileri sistematik biçimde topladı. Amaç, kanserlerin genetik ve epigenetik temelini tanımlayarak tanı, tedavi ve prognostik biyobelirteçlerin geliştirilmesine zemin hazırlamaktı.
Proje, glioblastoma, akciğer adenokarsinomu, meme, kolon ve karaciğer kanserleri dahil olmak üzere birçok tümör tipinde alt tiplerin belirlenmesini sağladı. TCGA verileri, binlerce akademik yayına kaynak olmuş ve uluslararası onkogenomik çalışmalar için referans seti hâline gelmiştir.
2017’de tamamlanan TCGA’nın verileri, ABD Ulusal Kanser Enstitüsü’nün Genomic Data Commons (GDC) üzerinden araştırmacılara sunulmaktadır. Bu kaynak, International Cancer Genome Consortium gibi küresel girişimlerle birlikte çalışarak kanser genomi araştırmalarının sürdürülebilirliğini desteklemektedir.
TCGA, biyoinformatik, veri paylaşımı ve sistem biyolojisi alanlarında yeni standartlar belirlemiş, kişiselleştirilmiş onkoloji yaklaşımlarının temelini oluşturmuştur. Bugün, “TCGA veri setleri” kanser genomi araştırmalarında altın standart kabul edilmektedir.
TCGA'nın temel amacı, kanser oluşumuna katkıda bulunan genomik değişiklikleri kapsamlı biçimde kataloglamak ve bu bilgileri araştırmacıların kullanımına açmaktı. Proje; DNA mutasyonları, gen ekspresyonu, DNA metilasyonu, kopya sayı değişiklikleri, mikroRNA profilleri ve protein düzeyindeki değişimler gibi çok sayıda moleküler veri türünü bir araya getirdi.
