Biyoinformatik dünyasına kaliteli, özgün ve Türkçe içerikler kazandırmayı hedefleyen bir platform..

Biyolojik veriler, özellikle sekans verilerinin yığılmaya başladığı son çeyrek asırda geometrik bir artış izleyerek devasa boyutlara ulaşmıştır. Örneğin: NGS, Yeni nesil dizileme teknolojisi hayal bile edilemeyecek kadar çok bilgi ve yeni yaklaşımlar sağlar. Fakat bu kadar çok bilginin depolanması, analizi ve değerlendirmesinde büyük güçlükler vardır. Yeni nesil DNA dizileme teknolojisinin başarılı bir şekilde kullanılması için gelişmiş biyoinformatik analiz araçlarına ihtiyaç duyulmaktadır.

Bilgisayar Analiz Kapasitesindeki Donanımsal Sorunlar

Yüksek hızda moleküler veri üretilmesine karşın bilgisayar teknolojisindeki donanımsal gelişmeler bu hıza yetişememektedir. Sekanslama hızı ile bilgisayar donanımı geliştirme hızı arasındaki makas açıldıkça sorun daha da büyümektedir. Örnek verecek olursak 500 milyon kısa okumadan oluşan bir kütüphanenin birleştirilmesi için bir bilgisayar 256GB RAM'e ihtiyaç duymaktadır.

Ancak bilgisayar donanımlarının geliştirilmesi amacıyla oyun sektörüne yapılan yatırımlar, biyoinformatik dünyasına doğrudan olmasa da dolaylı olarak pozitif bir katkı sunmaktadır.

Genomik Analiz Araçlarının Ücretli ya da Kapalı Kaynak Olması

Genomik verilerdeki bu artışa paralel olarak genomik analiz araçlarının da aynı derecede hızlı olarak üretilmesi gerekmektedir. Ticari firmalar ücretli ve kaynak kodları kapalı veri analiz araçları üretmekteler, bunlar oldukça kullanışlı olsa dahi yüksek maliyetlerinden dolayı çeşitli kısıtlamalara sebep olmaktadır. Açık kaynak yazılımlar, ücretsiz programlar ve R programı üzerinde geliştirilmiş, ücretsiz kullanıma açık veri işleme ve analiz paketleri bu sorunun üstesinden gelmek için araştırmacılara oldukça avantaj sağlamaktadır.

Biyoinformatik uzmanları tarafından geliştirilen ücretsiz araçlar, araştırmacılara çalışmalarında katkı sunabilir ve üretilen açık kaynak yazılımlar sayesinde, biri tarafından üretilen yazılım başka birçok yazılımcı tarafından incelenerek hem hataları düzeltilebilir hem de daha ileri seviyede yeni yazılımlara dönüşebilir.

Büyük Veriyi İşleyebilecek Biyoinformatik Uzmanlarına İhtiyaç Duyulması

Biyoloji bilenlerin yazılım bilmesi, yazılım bilenlerin ise biyoloji bilmesi gereken bir durum söz konusu olduğundan, biyoinformatik uzmanlarının; biyoloji, yazılım ve veri bilimi alanında kendilerini geliştirerek büyük verileri işleyecek şekilde uzmanlaşmaları gerekmektedir. Günümüzde büyük ticari şirketlerde istihdam edilecek çok sayıda biyoinformatik uzmanı işe alınmaktadır.