Bitkilerde gen aktarımında 3 metot yaygın olarak kullanılmaktadır:

Bakteri

Bir bakteri türünün Agrobacterium tumefaciens aracı olarak kullanıldığı mekanizmadır. Bu bakteri sahip olduğu plazmit aracılığıyla bitkilerin genetik yapısına kendi tümör yapıcı genini bırakabilmektedir.

Virüs

Bakteri yerine aracı olarak virüsler kullanılır.

Biyolistik Islah (Gen tabancası)

Bitki dokularının gen parçacıkları ile bombardımana tutulması için geliştirilen balistik ıslah metodu. Agrobacterium aracılığıyla transformasyon dışında en çok kullanılan transformasyon yöntemidir.

Mikroenjeksiyon

Bir enjeksiyon pipeti aracılığıyla DNA’nın doğrudan bitki hücresinin içine sokulmasıdır.

Elektroporasyon

Çok güçlü elektrik akımı ile hücre zarında geçici porlar oluşturularak DNA'nın hücre içine sokulmasıdır.