Genotipleme, bir bireyin DNA'sındaki belirli genetik varyasyonları belirleme işlemidir. Bu varyasyonlar, tek bir nükleotid değişiklikleri (SNP'ler) veya daha büyük DNA parçaları (insertions, deletions, copy number variations) şeklinde olabilirler.
Genotipleme işlemi, bireylerin genotiplerinin belirlenmesine yardımcı olan moleküler teknikler kullanılarak gerçekleştirilir. Bu teknikler arasında polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), restriksiyon enzim sindirimi, allel özelleştirilmiş sondalar, genetik mikroçip (array), ve son zamanlarda yaygın olarak kullanılan genetik sekanslama yöntemleri yer almaktadır.
Genotipleme verileri, genetik hastalıkların risk tahmini, ilaç etkinliği, ataların belirlenmesi, popülasyon genetiği, filogenetik analiz ve genomik araştırmalar gibi birçok alanda kullanılabilir.
